Ist schon ein paar Jahre her, aber grundsätzlich bieten sich bei der Fähre zwei Varianten an:
1. Weniger km mit dem Mopped, dafür etwas teurer und länger mit Übernachtung auf der Fähre.
Das haben wir damals gewählt von Genua aus und so würde ich es auch wieder machen. Man steigt abends in die Fähre und kommt ausgeschlafen auf der Insel an und kann direkt zur ersten Tagestour starten.
2. Mehr km mit dem Mopped, dafür günstigere und schnellere Überfahrt.
Livorno oder Piombino wären hier die typischen Abfahrtshäfen.
Zur Übernachtung kann ich nix sagen - wir waren mit dem Zelt unterwegs und haben an drei verschiedenen Standorten gecampt.